In The Guild of Merchant Explorers begint elke speler met één stad op zijn persoonlijke kaartbord.
Schud de stapel terreinkaarten, en onthul dan de meeste van deze kaarten één voor één. Op basis van het onthulde terrein plaatst elke speler op zijn bord blokjes die verbonden zijn met zijn startstad of andere blokjes. Je wilt gebieden op je bord voltooien, de zeeën oversteken naar nieuw land, en nieuwe steden op het bord stichten. Je kunt gekapseisde schepen verkennen op zoek naar schatten - wat je speciale plaatsingsmogelijkheden geeft - en verbonden verbindingen leggen tussen plaatsen om bonuspunten te scoren. Gemeenschappelijke doelstellingen kunnen door alle spelers worden voltooid, waarbij wie ze het eerst voltooit meer punten scoort.
Aan het eind van een ronde worden alle blokjes van elk bord verwijderd, zodat alleen de steden overblijven, dus als je geen nieuwe steden sticht, zit je op dezelfde plaatsen vast.
The Guild of Merchant Explorers bevat meerdere kopieën van vier verschillende kaarten, en het spel is zo ontworpen dat je met een of meer exemplaren op afstand kunt spelen.